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Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  43 lines
  1. *********************************************************
  2. * Transcriptional antiterminators bglG family signature *
  3. *********************************************************
  4.  
  5. Escherichia coli bglG  protein  mediates  the positive regulation of the beta-
  6. glucoside (bgl) operon  by  functioning  as a  transcriptional antiterminator.
  7. bglG is a RNA-binding protein that recognizes a specific sequence located just
  8. upstream of two termination sites within the operon.   The activity of bglG is
  9. supressed by its phosphorylation [2] by bglF (EII-bgl), the  permease from the
  10. beta-glucoside PTS system.
  11.  
  12. BglG is highly similar to the following proteins, which  also  probably act as
  13. transcriptional antiterminators:
  14.  
  15.  - arbG  from  Erwinia chrysanthemi [3], also  involved in the regulation of a
  16.    beta-glucoside operon. ArbG is probably phosphorylated by arbF (EII-bgl).
  17.  - sacT from Bacillus subtilis,  which regulates the expression of the sucrose
  18.    operon (sacPA). SacT is probably phosphorylated by sacP (EII-scr).
  19.  - sacY from  Bacillus  subtilis,   which  regulates  the  expression  of  the
  20.    levansucrase operon (sacBX).  SacY is  probably  phosphorylated by the sacX
  21.    protein.
  22.  - levR from Bacillus subtilis, which regulates the expression of the levanase
  23.    operon (levDEFG and sacC). LevR is  composed  of  two domains: a N-terminal
  24.    section that contains a  sigma-54 factor interaction ATP-binding domain and
  25.    a C-terminal  bglG-like  domain.  LevR  could  be phosphorylated by levD or
  26.    levE.
  27.  
  28. As a signature pattern for these proteins, we selected a conserved region that
  29. includes a conserved histidine that could be the site of phosphorylation.
  30.  
  31. -Consensus pattern: [ST]-x-H-x(2)-[FA](2)-[LIVM]-x-R-x(2)-[QN]
  32.                     [H could be phosphorylated]
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Escherichia coli feoB.
  35. -Last update: June 1994 / Text revised.
  36.  
  37. [ 1] Houman F., Diaz-Torre M.R., Wright A.
  38.      Cell 62:1153-1163(1990).
  39. [ 2] Amster-Choder O., Wright A.
  40.      Science 249:540-542(1990).
  41. [ 3] El Hassouni M., Henrissat B., Chippaux M., Barras F.
  42.      J. Bacteriol. 174:765-777(1992).
  43.